馬串山城は堂洞城主岸勘解由の城であり、元亀年間の三月に勘解由が肥田氏の長寿丸と酒宴の席で盟約を交わしたことによって毛利山城と交換された。これにより肥田氏は小山・南川合・牧野の地域を領有することとなった。

天正十年（1582）春、金山城主・森長可より使者がきて、馬串山所望と申し入れた。肥田玄蕃は理由なきこととして拒否した。同年六月、本能寺の変が起こると、長可は信州海津城から帰る。肥田玄蕃は、これに対抗して長可の帰路で木曽義昌と東濃の諸将らとともに暗殺を目論んだ。しかし長可が義昌の子を人質にとった為、失敗に終わる。

本能寺の変の一年後、長可は本能寺の変で亡くなった蘭丸など弟の供養と称して、玄蕃のいる福島城を急襲。当城主には玄蕃の子長寿丸がいたが、福島城の異変をみて救援に向かうも途中で没し、また城も落城した。