慶長九年（1604）、井伊氏が築いたところであり、代々ここに居た。
井伊氏の姓は藤原左大臣冬嗣から出た。冬嗣第七子を内舎人良門という。良門の五世の孫・備中守共資が遠江国村櫛に居り、その子を備中大夫共保という。その子孫・信濃守直平が井伊谷に移り住み、よって井伊氏と称した。直平は今川氏に仕え、宮内少輔直宗、信濃守直盛と代々続き、永禄三年（1560）五月、直盛は今川義元に従って桶狭間で戦死した。
叔父・直満の子の直親が継ぎ、家臣がこれを奉じて信州伊那に匿った。やがて再び井伊谷に帰り、奥山因幡守を頼った。間もなく讒言する者があり、直親が織田・徳川の両氏に通じている、と。今川氏真は怒り、これを攻めようとした。直親は自ら冤罪を申し開こうと駿府へ赴こうとしたが、途中で戦死した。
その子・万千代（のち直政）は生後二歳であり、氏真は殺そうとした。家臣の新野親規がこれを請い養育した。その妻は一寺に託し、のちに松平清景に再嫁し、孤児を迎えて養育した。天正元年（1573）、徳川家康が出かけて猟をした際、一人の子供を見て尋ねたところ、井伊氏の遺児であった。そこでこれを連れ帰って侍臣とした。のちに井伊谷を与え、木俣・椋原・西郷の三臣に補佐させて、十五歳になると元服し直政と名付けた。
天正十年（1582）春、武田氏を滅ぼし、その家臣を直政に与えた。軍装はみな赤を用いた。七月、駿河田（高田等）二万石を加えられ、旧領と併せて四万石となった。十二年（1584）、小牧山の戦に先鋒となり、堀秀政を撃って破った。六月、蟹江城を取り、八月、二万石を加増された。十三年（1585）、信州に入り真田氏と戦った。十四年（1586）、家康が京に入った際、豊臣秀吉の母が人質として岡崎城にやって来た。直政はこれを警護し、非常に手厚くもてなした。十一月、従五位下に叙され、兵部大輔に任じられた。十八年（1590）、小田原の陣に従軍して功をたて、八月に上野箕輪に封じられ、十二万石を領した。十九年（1591）、奥羽に入り九戸氏を攻めた。
慶長三年（1598）、豊臣秀吉が崩御し、大坂の奉行らが家康を除こうとした。直政は伏見におり、常に家康を擁護した。五年（1600）六月、家康は上杉氏を討ち、直政は従って小山へ赴いた。八月、大坂の兵（反家康軍）が出発し、先鋒となって美濃に入った。関ヶ原の戦いでは軍功はたいへん多く、十二月に佐和山城に封じられ十八万石を領した。七年（1602）二月、直政は没した。年四十二。直政は徳川氏の創業を助け、偉大な功績は諸将の中で抜きん出ており、徳川功臣の第一に位置する。
これより先、家康の命を受け金亀山に城を築いていたが、未だ成らず没した。長子の直勝が継ぎ、八年（1603）二月、正五位下に叙され、右近大夫に任じられた。九年（1604）、徳川氏が築城の事を監督し、城が完成して彦根城と名付け、直勝はここに移った。十一年（1606）五月、直勝は従四位下兵部少輔に進んだ。この年、天守閣が完成した。
彦根の名は、金亀山に活津彦根命が降臨されたことから名付いたという。金亀山に観音堂があり、昔は彦根山の観音といって天皇の行幸があったほか、二條天皇の勅願所となっていた。井伊氏が城を築くときにこれを山の下に移した。
十八年（1613）徳川氏は直勝に諭して異母弟の直孝に家督を譲らせ、直勝を安中に移した。十九年（1614）冬、大坂の陣で直孝は先鋒となり、元和元年（1615）夏、再び先鋒となって大坂を攻め、豊臣氏は滅んだ。六月、五万石を加えられた。直孝は従五位下掃部頭に任じられていたが、ここに至って四位侍従に進んだ。五年（1619）さらに五万石を加えられた。寛永二年（1625）大老となり、三年（1626）八月左少将となった。十年（1633）四月、五万石を加えられ、十一年（1634）七月、さらに五万石を加えられ、併せて三十五万石を領した。正保二年（1645）四月、正四位上左中将に昇進した。万治二年（1659）六月没した。年七十。
長子の靱負佐直滋は病気があり、四子の玄蕃頭直澄が継いだ。従四位下侍従となり、寛文五年（1665）四月大老となり、左少将に進み掃部頭に任じられた。延宝三年（1675）十一月に没した。年五十一。
兄・直時の子の玄蕃頭直興が継いだ。掃部頭・左少将となり、元禄八年（1695）十一月に老中となり、十年（1697）六月に大老となり、左中将に任じられた。十四年（1701）三月隠居し、次子・直通が継いだ。従四位下侍従・掃部頭となり、左少将に進んだ。宝永七年（1710）七月、直通は没した。年二十二。
弟の主計頭が継ぎ、従四位下侍従・掃部頭に任じられたが、十月に没した。年十八。
弟の直惟が嗣子となったが、なお幼少であったため、父の直興が再び家督を継ぎ、さらに直該と改名した。正徳元年（1711）二月、再び大老となり、十月に正四位上左中将に進んだ。四年（1714）四月隠居し、備中守直惟が継いだ。五年（1715）四月、左少将・掃部頭に任じられた。享保三年（1718）四月、直該没し、年六十二。十年（1725）二月、直惟は左中将に任じられ、二十年（1735）五月に隠居した。
弟の因幡守直定が継ぎ、掃部頭に転じて左少将に任じられた。元文元年（1736）六月、直惟没し、年四十五。二年（1737）二月、直定は左中将に任じられ、宝暦四年（1754）六月に隠居した。
兄・直惟の子である備中守直禔が継いだが、まもなく病気になり、八月に没した。年二十八。九月、直定が再び家督を継ぎ、五年（1755）七月に隠居した。
直惟の子・直幸が継ぎ、掃部頭に任じられた。十年（1760）十一月に左少将に任じられ、十三年（1763）九月に従四位上に叙された。明和二年（1765）十月に左中将に任じられ、安永七年（1778）正月に正四位上に進んだ。天明四年（1784）十一月、大老となり、七年（1787）九月に病気のため辞職した。寛政元年（1789）二月、直幸は没した。
第四子の直中が継ぎ、掃部頭に任じられた。八年（1796）十月に左中将に任じられ、正四位上に進んだ。文化九年（1812）に隠居した。
次子・直亮が継ぎ、掃部頭に任じられた。十一年（1814）五月に左少将に任じられ、十四年（1817）二月に従四位上に叙されて左中将に任じられた。天保六年（1835）十二月に大老となり、十二年（1841）五月に職を辞した。
のち義弟の直弼が継ぎ、従四位下左少将・掃部頭に任じられた。のちに正四位上左中将に進んだ。安政五年（1858）四月、大老となった。これより前、アメリカの使節が浦賀に来航して和親を求めたため、幕府はその措置に苦しんだ。そして攘夷の説が天下に起こり物議騒然となった。直弼は海外の情勢を察して攘夷が誤りであることを知り、アメリカと和親を結んで貿易を許した。そのため一時的に人心を激昂させたが、後世はその卓見に感服した。万延元年（1860）三月三日、登城の道中、桜田門外において過激派の難に遭った。実に惜しまれることである。
文久二年（1862）十一月、その子・直憲が継ぎ、従四位下に叙され左少将・掃部頭に任じられ、のち左中将に進んだ。明治二年（1869）六月、版籍奉還を行い、四年（1871）七月に廃藩となった。
参考
『近江名跡案内図』（静里北川舜治、明治二十四年-1891）